Hướng dẫn Liên ngành nêu rõ những việc cần làm của từng bộ phận, thành viên trong nhà trường (giáo viên, học sinh, nhân viên y tế...) ở 2 giai đoạn: Trước khi học sinh trở lại trường và khi học sinh đi học trở lại.
Đối với trường học, các việc quan trọng cần làm là: Vệ sinh khử khuẩn, đảm bảo cơ sở vật chất, tập huấn - tuyên truyền.
Đối với giáo viên: Hướng dẫn cha mẹ học sinh thực hiện nội quy; theo dõi sức khỏe học sinh; tiêm đủ 2 mũi vắc xin, ...
Còn đối với học sinh, một trong những việc quan trọng trong giai đoạn này là giữ gìn sức khỏe (thường xuyên súc miệng, họng; giữ ấm cơ thể, tăng cường tập thể dục, ăn chín, uống sôi, bảo đảm chế độ dinh dưỡng, thường xuyên rửa tay với nước sạch và xà phòng...); tự theo dõi sức khỏe, nếu có ho, sốt, khó thở thì báo ngay cho nhà trường; đồng thời đăng ký tiêm vắc-xin phòng Covid-19 theo hướng dẫn của cơ quan y tế.
Ngoài các hướng dẫn trên đây, Hướng dẫn Liên ngành Sở Giáo dục và Đào tạo và Sở Y tế Hà Nội cũng cung cấp bộ 16 tiêu chí đánh giá trước, trong và sau khi học sinh đến trường học. Mỗi tiêu chí đánh giá ở hai mức: Đạt và Không đạt. Số tiêu chí đạt càng nhiều thì mức độ an toàn càng cao, trường học càng an toàn và ngược lại.
Hướng dẫn Liên ngành là căn cứ để các đơn vị, trường học thực hiện tốt công tác chuẩn bị, sẵn sàng đón học sinh trở lại trường học khi đủ điều kiện. Các đơn vị, trường học trên địa bàn cần chuẩn bị chu đáo, đầy đủ các công việc đã được quy định.
Nội dung chi tiết của Hướng dẫn liên ngành như sau: